Etiketter

Leta i den här bloggen

tisdag 24 oktober 2017

B12 rakenteesta. Kobalamiini, Korrinoidi (Cobalamin, Corrinoid)


W Friedrich kertoi kirjassaan Vitamiini t(1988) jotain B12- vitamiinista 


1822 ensimmäinen kliininen kuvaus pernisiöösianemiasta tehdään (J S Combe)
1849 tarkempi kuvaus ( T Addison, ”Addisonin anemia”).
1872 progressiivinen pernisiöösi anemia, PA, ( A Biermer; ” Biermers anemia”)
1926 anemia on luonteeltaan fataali ( FA Evans)
1920 anemiaan voi vaikuttaa syömällä 120-240 g maksaa päivittäin ( GH Whipple)
1928 IF tekijä: anti-pernisiöösinen  tekijä riippuu mahanesteen” intrinsic factorin” interaktiosta animaalisen proteiinin tuomaan ”extrinsic factoriin”, jota on lähinnä maksassa ( WB Castle)- Sen eristämistä alettiin tehdä( EJ Cohn)
Mahanesteen eritys on kovasti alentunut PA- potilailla ( pernisiöösianemiapotilailla) limakalvoatrofian takia. Kokeissa käytettiin terveitten syömän pihvin (extrinsic factor) jälkeisen mahanesteen (intrinsic factor) syöttöä potilaille, joitten verenkuva parani 7-10 pv kuluttua huomattavasti. Alettiin tutkia intrinsic faktoria toisena parantavana seikkana.
(Sittemmin havaittiin että extrinsic factor yksinäänkin esim parenteraalisti on tehokas.)
1934 Nobelin palkinto löydöstä, että maksaa syömällä voi vaikuttaa pernisiöösianemiaan ( Whipple, Minot, Murphy)
Nykyään tiedetään , että ”extrinsic factor” on B12-vitamiini.
1935 Vitamiini B12 saatu eristettyä ( HD Dakin, R West), myös 1936 ( Y Subbarov)
1946 on saatu tehtyä preparaattia , jossa oli tehoa jo 1 mg määrässä, vaikka se oli 1% vitamiinin suhteen (WB Emery, LFJ Parker) Havaittiin, että millään eläimellä ei ole pernisiöösianemiaa, joten eläinkokeita ei voitu tehdä)
1947 havaitaan, että antipernisiöösianemiatekijä on välttämätön kasvutekijä Lactobacillus lactis Dorner-bakteerityypille (LLD) ( Mary Shorb). Koska vitamiinin havaitseminen tuli mikrobiologisesti mahdolliseksi, preparaatin valmistus nopeutui.
1947 pystytään valmistamaan B12-vitamiinikristalleja ( K Folkers; Merck laboratorio) CNCbl
1948 Punaisen aineen aktiviteetti oli 11 000000 LLD yksikköä/ mg ( Rickers et al)
1948 julkaisee Glaxo Smith myös asiasta tuloksen ( Smith et al.) Vesiliukoisuuden takia käytettiin ryhmänimeä ”B-vitamiini”. Siihen aikaan meni 15 mg kristallimäärän tekoon tuhat kiloa raakaa maksaa.
Se että mikrobit tuottavat B12, oli ekonomisesti hyvin merkittävä keksintö ja mikrobivälitteiseen vitamiini B12 valmistuksessa siirryttiin lääketehtaissa.
Vitamiinin kemiallisen kaavan määrittivät tutkijaryhmät K Folkers ( Merck) ja E Lester Smith ( Glaxo). British Drug House, Cambridge ja Organon olivat mukana myös omilta osiltaan.
1955 Täydellinen rakenneselvitys saadan tehdyksi. Aletaan käyttää nimitystä korriini (corrin), vitamiini B12 ja korrinoidit (corrinoids) Röntgenanalyysitekniikan toi DC Hodgin, jolla löydettiin korrinoidirenkaan stabiilius ja havaittiin B12 olevan monimutkainen kobolttikompleksi, josta valotettaessa erkanee syaanivetyhappoa
1958 bakteereista eristettiin oranssia ”B12 coentsyymiä”, joka oli valoherkkää ja hajosi aqua-cobalamiiniksi (AqCbl).
Luonnollisessa B12- coentsyymissä ei lie CN ( syanidi) ryhmää.
1960 kemiallinen puolisynteesi alkaen kobyyrihaposta ( cobyric acid)
1961 Adenosyyli on koboltissa kiinni C-5` hiilensä avulla” B12 coensyymin” Adenosylkobolamin (AdoCbl) hajotessa tulee puriiniadeniinia ja tyydyttämätöntä pentoosia koboltista irtautumalla.
1962 AdoCbl saadaan osittain syntetisoitumaan ( Bernhauer, Lester-Smith, Johnson)
Synteesi perustuu Co-atomin reduktioon (Co[III] Co[I]) ja sen reaktioon aktivoidun adenosiinin C-5` asemaan (Adenosiinia taas aktivoitiin esteröimällä eräällä sulfonihapolla).
Cyanomuoto kobalamiinia (CNCbl) ei ole luonnollinen muoto, mutta se on pysyvämpää ja kestää valovaikutusta. 
  •  (Huom:  Koska AdoCbl on valonherkkä,CNCbl on helpompi eristämisvaiheessa, mutta sen täytyy muuttua kehossa kofaktorimuotoihin AdoCbl ja CH3Cbl) (Mitenkähän paljon CNCbl-muoto esiintyy tupakoivulla?? Tai tupakalle passiivisti altistuneilla??)
Samat tutkijaryhmät ryhmät syntetisoivat metyylikobolamiinia CH3CBL
1964 Nobelin palkinto Dorothy Hodginille B12 vitamiinin rakenteen selvittelystä.
1964 Käyttämällä metyylijodidia saatiin syntymään metyylikobalamiini: MeCbl, CH3Cbl. Metyyli sitoutuu suoraan kobolttimolekyyliin. Tämäkin on valoherkkä yhdiste ja eristettävissä ihmisen maksasta ja veriplasmasta sekä bakteereista. ( K Lindstrand)
 Metyylikobolamiini on toinen B12 vitamiinin koentsyymimuoto.
1970 voitiin tehdä de novo- synteesi (Woodward, Eschenmoser)

AdoCbl tarvitaan propionihapon konvertoitumisessa meripihkahapoksi, sitruunahappokierron jäseneksi. Propionihappoa kehittyy metaboliassa jatkuvasti eri lähteistä, kuten rasvahappojen kolmen hiilen tähteestä, pyrimidiinien hajotessa, valiinin metaboliasta.
  •  Propionilähteet olisi tutkimusaihe sinänsä. (Propioniderivaattojen avulla konservoidaan nykyisin jauhoja, esim perunajauhoja kestävään muotoon). Propionit ovat  hieman hämärässä oleva metabolinen alue.
CH3Cbl tarvitaan yhdessä foolihapon kanssa metioniinin biosynteesiin maksassa ja bakteereissa.
Koentsyymit ”Vitamiini B12 ” ovat :
AdoCbl, (Adenosylkobolamiini); ”Coentsyymi B12 ”, hallitseva coentsyymi
5-deoxyadenosyl Cbl ( 5-deoxyadenosylkobalamiini).
  jA  CH3-Cbl ( metylkobalamiini) toinen ”Coentsyymi B12 ”

Eri kobalamiineja on luonnossa paljon. Ihmisen tärkeän koentsyymi B12 puitteissa puhutaan seuraavista corrinoideista vertaillen.
Koboltin beta-ligandin mukaan kobalamiinit nimetään seuraavasti:
CNCbl ( cyanokobalamiini),
OH-Cbl ( hydroxocobalamiini) (B12 a)
AqCbl, H2O-Cbl  (aquakobalamiini) (B12 b);
NO2 (nitrokobalamiini) (B12 c)

B12:n makrorengasmainen molekyyli omaa keskustassaan kobolttiatomin (Co) , joka on littynyt erittäin tiukasti koordinaatiosidoksilla neljään pyrrolirakenteeseen, niiden N-molekyyleihin.
Korriinirenkaassa on neljä redusoitua pyrrolia (A,B,C, D), jotka ovat linkkiytyneet keskenään kolmella metyleenisillalla (-CH=) A-B, B-C ja C-D väleissä; A ja D pyrrolit ovat liittyneet suoralla sidoksella toisiinsa ( mikä on perusero korriinirakenteen ja porfyriinirakenteen kesken)
Co- atomissa on mainittujen neljän kooordinaatiosidoksen lisäksi paikkaa kahdelle ligandille. Toinen on alfaligandi ja toinen on betaligandi ( , jonka  jälimmäisen mukaan kobalamiinin nimikin muodostuu).
Alfaligandina on nukleotidi: heterosyklinen rengas, jossa on riboosi ja fosfaatti. Alfa-asema voi olla myös vapaana ligandista.
Kobalamiineissa ribonukleosidi on alfa-D-ribofuranosyl-5,6-dimethylbenzimidazol (.lyhyesti alfa-ribazol.

B12-vitamiininrakenteen kobolttiatomi ei ole vaihdettavissa toiseen netalliin ( ilman vitamiinimerkityksen katoamista). On löydetty bakteereista joukko koboltittomia B12- analogeja ja on ollut mahdollista inkorporoida niihin eri atomeja kuten Co, Cu, Ni, Rh, Mn ja Fe, mutta ilman kobolttia (Co) näillä korrinoideilla ei ole mitään biologista aktiivisuutta.

Mitä muuta erikoista on korriinirakenteessa verrattuna esim hemirakenteeseen ja klorofylliin. Korriinilla on vähemmän kaksoissidoksia kuin porfyriinillä ja lisäksi korriinilla on lisämetyyliryhmä ja sen karboksyyliä sisältävissä sivuketjuissa on amideja, mitä taas ei ole klorofyllissä ja hemissä. Korriinin lisämetyyli vaikuttaa sen, että rengasstatus on kuin  ”redusoitu porfyriinirengas" ja suora A- ja D-pyrrolin liittymä on ”keskeytettyä konjugaatiota” verrattuna porfyriiniin. Korriinin makrorenkaan sisäpiiri muodostuu 15 molekyylistä ja niistä 12 on suoranaisesti yhteydessä toisiinsa ( kolme muodostaa siltoja).















Korriinirengas numeroidaan samaan tapaan kuin porfyriinirengas, vaikka korriinista puuttuu atomi numero 20. Redusoitu pyrrolirengas kantaa säännöllisen systeemin substituentteja beta-asemissaan: On neljä propioniamidia, kolme asetamidia ja viisi metyyliryhmää. (Niiden steerinen asettuma erottaa korriinia uroporfyriini III rakenteesta) Korriinirengas on planaarinen.
 Seitsemästä karboxamidiryhmistä kuusi on primääriamideja. Propionamidiryhmä sijaitsee D-renkaassa ja on kompleksisempi (propanolamidi) linkkiytyen ribonukleosidiin, joka on liittynyt myös Co-atomiin alfaligandina toisaalta ( nukleotidinsa N- molekyyliin)


Kobalamineiksi sanotaan niitä rakenteita, joissa on alfa-ligandina 5,6-dimetyylibenzimidazolia ja niistä ensimmäinen eristetty oli syanokobalamiini CNCbl, siis beta-ligandina syanidijoni  CN. (Kuvan R kohdassa)

      • Non-korrinoidit

B12 analogeja esiintyy: näissä voi olla korriinirenkaassa olevan 5,6-dimetyylibentsoimidatsolirenkaan asemasta toinen bentsoimidatsolirengas, puriini, emäs tai fenoliryhmä.
Vain sellaiset kobalamiinit, joissa on korriinia, osoittavat ihmisessa B12-  aktiivisuutta, mutta muut analogit ovat inaktiiveja.

      • Nomenklatuuria


Cobinic acid: Kobiinihappo ( ei esiinny luonnossa)
Jos kaikki yllä mainitut amidiryhmät  paitsi propanolamidi), muutetaan COOH karboksyyliryhmiksi, molekyyli on Kobiinihappo, ”cobinic acid”, nukleotidivapaa hexakarbonihappo.

Cobinamide, Kobinamidin on  edellämainitun hexacarbonihapon amidi, hexa-amidi,
Kobinamidi eroaa B12-vitamiinista ( cobalamiinista) vain siten, että siitä puuttuu  essentiellit emäs, riboosi ja fosforihappo.  Sitä esiintyy luonnossa.

Cobamic acid: Kobaamihappo ( ei esiinny luonnossa). Se on hexacarbonihappo, jossa kaikki primääriamidiryhmät ovat konvertoituneet karboksyyleiksi ja josta puuttuu benzimidatsoli.

Kobaamihapon hexa-amidi on
Cobamide, Kopamidia ei esiinny luonnossa  (Se on kuin  B12 mutta ilman sen essentielliä  emästä, bentsimidatsolia)

*Cobalamin, Kobalamiini, on täten
5,6-dimethylbentzimidazolyl-cobamide. (B12-vitamiinin)

Pseudovitamiini B12”
Adenylcopamide
Factor III”  
5-hydroxybenzimidatzolylcobamide

Cobyrinic acid , kobyriinihappo
Kobyriinihappo on kaikkein primitiivisin luonnosota löytynyt korrinoidi, jossa kaikki sen -COOH ryhmät ovat vapaina

Cobyric acid , kobyyrihappo edellisen hexa-amidi.
=abcdeg cobyrinic acid hecaamide.

Siis:
Kobalamiini on B 12 vitamiini.
Kobyriinihappo, kobyyrihappo ja kobinamidi ovat luonnontuotteita.
Kobiinihappo, kobaamihappo ja kobamidi eivät esiinny luonnossa ja ne termit ovat lähinnä korrinoidien nomenklatuurissa tärkeitä.


Inga kommentarer: